Il-missjoni tal-IAPMEI hija li tippromwovi l-kompetittività u t-tkabbir tan-negozju u li tappoġġja t-tfassil, l-implimentazzjoni u l-evalwazzjoni ta' politiki mmirati lejn l-attività industrijali. Tfittex ukoll li ssaħħaħ l-innovazzjoni, l-intraprenditorija u l-investiment fin-negozju f'kumpaniji li joperaw f'dawn l-oqsma taħt is-superviżjoni tal-Ministeru tal-Ekonomija, b'mod partikolari l-SMEs, bl-eċċezzjoni tas-settur tat-turiżmu u l-kompetenzi ta' kontroll rilevanti assenjati lid-Direttorat Ġenerali għall-Attivitajiet Ekonomiċi.