Misija IAPMEI-ja je promicanje konkurentnosti i rasta poslovanja te podrška oblikovanju, provedbi i evaluaciji politika usmjerenih na industrijsku aktivnost. Također nastoji ojačati inovacije, poduzetništvo i poslovna ulaganja u tvrtke koje posluju u tim područjima pod nadzorom Ministarstva gospodarstva, posebno mala i srednja poduzeća, s izuzetkom turističkog sektora i relevantnih kontrolnih nadležnosti dodijeljenih Glavnoj upravi za gospodarske aktivnosti.