L'Agence nationale de l'innovation (ANI) est chargée de mettre en œuvre les lignes directrices d'une stratégie d'innovation technologique et commerciale au Portugal de 2018 à 2030. L'ANI vise à encourager les investissements privés dans la recherche et le développement (R&D), ainsi qu'à promouvoir la collaboration entre les organisations scientifiques et technologiques. En outre, elle s'attache à intensifier la participation des entreprises scientifiques et technologiques nationales et d'autres entités aux réseaux et programmes internationaux, à savoir les établissements d'enseignement supérieur et les centres d'interface, en vue de promouvoir leurs capacités, leurs compétences et les résultats des politiques axées sur l'innovation.

L'Agence nationale de l'innovation (ANI) est également responsable de la diffusion des cas d'innovation réussie d'origine portugaise au niveau national et international, en collaboration avec d'autres entités, à savoir l'Institut de soutien aux petites et moyennes entreprises (IAPMEI), l'Agence portugaise pour le commerce mondial et l'investissement (AICEP ) et la Fondation pour la science et la technologie (FCT). Leur objectif commun est de contribuer à renforcer l'image du Portugal en tant que pays innovant et de justifier des investissements croissants, grâce à des retombées sur l'économie et sur le bien-être et la qualité de vie de la population. La poursuite de la mission de l'ANI sera présentée avec d'autres objectifs de politique publique, à savoir les priorités de la prochaine phase des fonds structurels, le programme national d'investissement 2020-2030, le programme national de réforme et la politique nationale d'aménagement du territoire , ainsi que les priorités et les objectifs associés à la participation du Portugal aux programmes de soutien à la R&D dans le cadre européen.