La Agencia Nacional de Innovación (ANI) es la encargada de aplicar las directrices de una estrategia de innovación tecnológica y empresarial en Portugal desde 2018 hasta 2030. La ANI pretende fomentar la inversión privada en investigación y desarrollo (I+D), así como promover la colaboración entre organizaciones científicas y tecnológicas. Además, se centra en intensificar la participación de las empresas científicas y tecnológicas nacionales y otras entidades en redes y programas internacionales, en concreto las instituciones de educación superior y los Centros de Interfaz, con el fin de promover sus capacidades, competencias y los resultados de las políticas impulsadas por la innovación.

La Agencia Nacional de Innovación (ANI) también es responsable de la difusión de casos exitosos de innovación basados en Portugal a nivel nacional e internacional, en colaboración con otras entidades, a saber, el Instituto de Apoyo a las Pequeñas y Medianas Empresas (IAPMEI), la Agencia de Comercio e Inversión Global de Portugal (AICEP) y la Fundación de Ciencia y Tecnología (FCT). Su objetivo conjunto es contribuir a potenciar la imagen de Portugal como país innovador y justificar el aumento de las inversiones, mediante el retorno a la economía y al bienestar y la calidad de vida de la población. La prosecución de la misión de la ANI se presentará junto con otros objetivos de las políticas públicas, a saber, las prioridades para la próxima fase de los Fondos Estructurales, el Programa Nacional de Inversiones 2020-2030, el Programa Nacional de Reformas y la Política Nacional de Ordenación del Territorio , así como las prioridades y objetivos asociados a la participación de Portugal en los programas de apoyo a la I+D en el marco europeo.