Das Prager Innovationsinstitut (PII) wurde im Januar 2020 gegründet. Die gemeinnützige Organisation wurde von der Hauptstadt Prag als eingetragenes Büro eingerichtet. Sie wird durch den Vorstand und den Aufsichtsrat kontrolliert. Das Hauptziel des PII ist die Planung, Unterstützung und Förderung von Bildung, Umweltschutz, der Infrastruktur der Stadt sowie von wissenschaftlichen, FuE-, kreativen, kulturellen und innovativen Unternehmen und nicht-wirtschaftlichen Aktivitäten, um die Wettbewerbsfähigkeit Prags zu verbessern. Die Rolle des PII besteht darin, die akademische, öffentliche und private Sphäre zu verbinden. Das PII wird von seiner Gründungsinstitution und durch EU-Förderprogramme finanziert. Es wird erwartet, dass in Zukunft auch private Mittel eine Rolle spielen werden. Die Hauptunterstützung konzentriert sich auf Projekte in den Bereichen Bildung, Energiesektor, künstliche Intelligenz, Kreativwirtschaft sowie auf Innovationen, die zur Verbesserung der Infrastruktur und der Umwelt der Stadt beitragen.